灰指甲治疗的关键，在于使用抗真菌药物等药物治疗和修剪指(趾)甲等物理治疗相结合的办法。

　　物理治疗：例如，使用外用药膏前用指甲锉刀尽量去除病甲，再外涂冰醋酸溶液或碘酊，直至新甲生成为止。

　　药物治疗：分外用药和口服药，外用药主要是加了抗真菌药物的软膏或喷雾剂，也要先软化指甲，药物才可能多渗入一点指甲中抑制真菌生长。口服药通过血液循环达到甲床，抑制真菌生长，这需要医生开处方，疗程也要用足，并定期监测肝肾功能。口服药物是目前相对理想的治疗方法，实际上发生肝损害的概率小于感冒药的影响。

　　要是遇到难治的甲下型灰指甲，此时感染部位在甲的深部，无论怎么用外用药物几乎没有作用，物理治疗也很难起效，只有靠口服抗真菌药，让甲床里流淌着带药的血液，才能保证新长出来的指甲都是健康的指甲，等到坏掉的指甲都慢慢被剪掉，这病才能治好。